В Vim файлы с виндовым форматом перехода на новую строку выглядели не очень красиво - каждая строка оканчивалась на ^M. Переконвертировать все PHP-скрипты в Unix-формат с обходом директорий можно командой

find . -name \*.php -type f -exec sed -i 's/\x0d$//g' {} \;

Кстати, слегка разобрался с Vim, поставил целый один плагин - phpfolding.vim. Цветовые схемы в комплекте очень уродские, пришлось качать с Инета.
На данный момент Vim умеет function un/folding, go to function definition (в том числе переход в другой файл), autocompletion (включая мои функции). В ближайшее время планирую научиться делать массовый find and replace, а также переход к matching bracket. Мне не у кого спрашивать, как работать в Vim (да и самому разобраться полезнее), поэтому поиск информации о том, как делать каждую фичу, отнимает довольно много времени.